Υβριδική εναρμόνιση δεδομένων
Διαθέτουμε μακρόχρονη εμπειρία στο χειρισμό δεδομένων και κοορτών από διαφορετικά κλινικά κέντρα και στην εναρμόνιση δεδομένων.
Ετερογένεια των δεδομένων
Προσφέρουμε μια υβριδική υπηρεσία εναρμόνισης δεδομένων, η οποία χρησιμοποιεί προηγμένους λεξιλογικούς και σημασιολογικούς αναλυτές για τον εντοπισμό ορολογιών με εννοιολογική και λεξιλογική βάση, με στόχο να ξεπεραστούν οι δομικές ετερογένειες σε αναδρομικά ιατρικά δεδομένα από διαφορετικά ιατρικά κέντρα. Για το σκοπό αυτό, χρησιμοποιούμε το WebProtege για να μετατρέψουμε τα συμβατικά μοντέλα δεδομένων σε οντολογίες (ιεραρχικά μοντέλα δεδομένων) προς τον ορισμό οντολογιών αναφοράς για διάφορες ασθένειες με σεβασμό στις αρχές HL7 FHIR και FAIR.
Οντολογίες αναφοράς
Οι οντολογίες αναφοράς εμπλουτίζονται με ενσωμάτωση λέξεων και πρόσθετες ορολογίες από το NLTK της Python και εξωτερικά λεξιλόγια (π.χ. OHDSI Athena) για τον ορισμό ενός μεγάλου σώματος κειμένων. Το σώμα δεδομένων αναπτύσσεται τελικά για τον εντοπισμό ορολογιών με κοινή εννοιολογική ή/και λεξιλογική βάση στις ακατέργαστες βάσεις δεδομένων ανά τομέα ενδιαφέροντος και οι τιμές τυποποιούνται σύμφωνα με την κλινική πρακτική.
Οι βασικοί μας παράγοντες διαφοροποίησης
εύκολο στη χρήση
Η ροή εργασιών εναρμόνισης δεδομένων απεικονίζεται στο Σχήμα 1 και αποτελείται από 4 στάδια, συμπεριλαμβανομένων των εξής: (i) εξαγωγή μεταδεδομένων και σχεσιακή μοντελοποίηση, ii) κατασκευή σημασιολογικών μοντέλων δεδομένων αναφοράς (οντολογιών) για τις καρδιαγγειακές και ψυχικές διαταραχές, iii) ανάπτυξη ιατρικών λεξικών με διασύνδεση των ενθυλακώσεων λέξεων από τις οντολογίες με εξωτερικά αποθετήρια γνώσης, όπως το OHDSI (Observational Health Data Sciences and Informatics) [15], και iv) λεξιλογική και σημασιολογική ανάλυση. Η τελευταία χτίζεται πάνω στα λεξικά για τον εντοπισμό ορολογιών με λεξιλογική και εννοιολογική βάση. Το αποτέλεσμα είναι μια έκθεση εναρμόνισης δεδομένων η οποία περιλαμβάνει τις βαθμολογίες αντιστοίχισης για κάθε ορολογία που εντοπίζεται μαζί με χρήσιμα μεταδεδομένα.
